Мальдивские рифы, могут похвастаться тем, что на них произрастают более 250 различных типов кораллов. На первый взгляд кораллы кажутся безжизненными, так как в своём большинстве они неподвижны (особенно твёрдые), на самом деле это скопление мельчайших животных - коралловых полипов, которые растут и образуют большие колонии. Каждый полип обёрнут сверху известняковой оболочкой, каждый новый рождённый полип прикрепляется к старому и то же начинает строить такую же оболочку. Большое количество мёртвых и живых полипов образуют коралловые рифы. В течение дня живые полипы дремлют, с наступлением ночи они протягивают щупальца в поисках пропитания - планктона. Коралловые рифы могут жить не везде, так как для их роста нужны определённые условия, а именно: температура воды не ниже + 20°С (поэтому коралловые рифы встречаются там, где есть теплые течения), чистая вода и проникающий в толщу воды свет, для процесса фотосинтеза. Особенно много кораллов в Красном море, в Индийском океане, а так же в Карибском бассейне, именно они имеют все необходимые условия для роста коралловых садов.
В окрестностях Мальдивских островов температура соответствует стандарту и составляет от +28 °С до +30 °С. Правда совсем недавно, вблизи архипелага произошло повышение температуры воды, вызванное течением Эль Ниньо, что привело к массовой гибели коралловых колоний на Мальдивских островах. Мальдивский народ относится к кораллам, как к народному достоянию, они их берегут и охраняют законом, в том числе и от туристов. Строго запрещено ломать кораллы и вывозить их за приделы страны. Многие биологи стараются возродить погибшие кораллы, выращивая их искусственно. Кораллы растут довольно медленно, многие из них в год прибавляют всего несколько миллиметров, другие при благоприятных условиях роста могут за год прибавить сразу 20 см.
В целом Мальдивы могут похвастаться очень красивыми кораллами, самых разных форм и расцветок, например голубого, красного и даже чёрного цвета. Здесь можно встретить кораллы похожие на оленьи рога, листовидные, пластинчатые, грибообразные и дисковидные кораллы и даже в форме грациозного веера. Коралловые рифы, расположенные ближе к океану, изрезаны трещинами, расселинами, имеют пещеры и туннели, в которых дайверы могут найти, прячущимися от дневного света, самых неожиданных представителей коралловой фауны.
На коралловых рифах обитают губки, черви, креветки, моллюски, всевозможные ракообразные, мидии, устрицы, рыбы-ласточки, индийская рыба-бабочка, амфитрион, рыба-клоун и др. Рядом с коралловыми рифами дайверы могут увидеть осьминогов, спрутов, морские звезды, морских ежей, морскую лилию, рыбу-бычка, крылатку, рыбу-ласточку, рыбу-хирурга, рыбу-попугай, мурену, рыбу-солдата, рыбу-клоун, морского ерша, пятнистого орляка, скатов, акулу молот, огромную китовую акулу и многие другие.
